Ein junger und schüchterner Junge, Danny, stellt sich eine wunderbare Welt vor, in der er und sein geliebter Hund, Charlie, die Hauptrolle in ihren eigenen Superheldenabenteuern spielen. Als Charlie auf mysteriöse Weise von Außerirdischen entführt wird, erhält er echte Superkräfte und entpuppt sich als Charlie de Wonderhond, der größte und berühmteste Superheldenhund, den die Welt je gesehen hat. Er ist bei allen beliebt, außer bei Puddy, der gemeinen Katze, die nebenan wohnt. Da das Schicksal der Menschheit auf dem Spiel steht, müssen Danny und Charlie alles daran setzen, Puddys teuflische Pläne zu vereiteln.