Le jeune Nanning, âgé de douze ans, vit sur une île idyllique des Wadden. Il chasse les phoques, pêche et aide à la ferme de sa famille. La vie semble belle et paisible, mais à Berlin, le Derde Rijk est en déclin. La vie de Ook Nannings commence lentement à sembler plus complexe qu'elle ne l'a jamais été.
« Amrum, 1945 » se distingue des autres films de guerre par le soin avec lequel l'innocence enfantine de Nanning est opposée aux convictions nazies de ses parents - sa mère est une fervente partisane du régime nazi et son père sert comme officier SS.