Michael De Geest es hijo de la pianista Monique Lanszweert y del organista Edward De Geest, organista titular honorario de la Catedral de San Bavón Gentse Sint. Obtuvo los títulos de licenciado y máster en educación en informática en la UGent, y el título de grado en órgano en el Conservatorium Gent. Además, realizó clases magistrales de órgano con Serge Schoonbroodt, Helga Schauerte y Liuwe Tamminga. Michael es profesor de órgano en la escuela de artes de Bruselas y ya ha dado recitales en numerosos países europeos y en Japón. En el ámbito de la música de cámara, actúa con la oboísta Dagmar Robben, su esposa. Además, es activo diariamente como administrador de la orquesta sinfónica Lumen Symphonicum, dirigida por su hermano David De Geest. En 2022, Michael fue nombrado organista titular de la iglesia de los Carmelitas en Brujas, sucediendo al renombrado Chris Dubois. En junio de 2023, fue homenajeado por la ciudad de Eeklo como ciudadano meritorio debido a sus logros artísticos. Con obras de, entre otros, G. Böhm, J.S. Bach, C. Dubois, F. Peeters y O. Messiaen