Michael De Geest è il figlio della pianista Monique Lanszweert e dell'organista Edward De Geest, organista titolare emerito della Cattedrale di Gentse Sint-San Bavone. Ha conseguito presso l'UGent i diplomi di licenza e master educativo in informatica, e presso il Conservatorium Gent il diploma di laurea in organo. Inoltre, ha seguito masterclass di organo con Serge Schoonbroodt, Helga Schauerte e Liuwe Tamminga. Michael è insegnante di organo presso la scuola d'arte di Bruxelles e ha già tenuto recital in numerosi paesi europei e in Giappone. In ambito di musica da camera si esibisce con l'oboista Dagmar Robben, sua moglie. Inoltre, è quotidianamente attivo come amministratore dell'orchestra sinfonica Lumen Symphonicum, diretta da suo fratello David De Geest. Nel 2022 Michael è stato nominato organista titolare della chiesa dei Carmelitani a Bruges, succedendo al rinomato Chris Dubois. Nel giugno 2023 è stato premiato dalla città di Eeklo come cittadino meritevole per i suoi risultati artistici. Con opere di, tra gli altri, G. Böhm, J.S. Bach, C. Dubois, F. Peeters e O. Messiaen